Diferentemente dos níveis 1 e 2 de biossegurança, um laboratório NB3 é um espaço dedicado a pesquisa e manipulação de agentes biológicos vivos, o que representa um grande risco de contaminação por agentes biológicos do laboratório. Assim, é necessária a implantação de medidas de segurança como sistemas de controle de acesso, separação física de laboratórios dos corredores, portas duplas, bloqueio de ar, impermeabilidade dos revestimentos de pisos, paredes e tetos, janelas lacradas, autoclave para descontaminação de resíduos.
A execução do projeto contou com a implantação de sistemas de ventilação totalmente independentes, contendo equipamentos de reserva de ventilação e exaustão que realizam um rigoroso controle de umidade e temperatura permanentemente. Esses sistemas utilizam filtros duplos HEPA e contam com cabines de segurança conectadas ao sistema de exaustão.
O laboratório possui instalações elétricas totalmente independentes, o que inclui sistemas de força, controle e aterramento e gerador próprio. Além disso, todo o sistema conta com um mecanismo de monitoramento contínuo e sistemas de comunicação de dados de voz, detecção de alarme de incêndio e controle de acessos.
Os sistemas hidráulicos do laboratório passaram importantes reformas. Foram instalados chuveiros para banho de limpeza pressurizados com sistema de aquecimento independentes e a rede de encanamentos do laboratório, toda refeita em aço inoxidável, ganhou uma caldeira elétrica com capacidade para alcançar temperatura de 121°, para onde o esgoto passou a ser direcionado para esterilização e desinfecção antes de ser despejado no sistema comum de esgotos do prédio.